Novotna ilgstoši cīnījās ar vēzi un savas pēdējās dienas pavadīja ģimenes lokā.
Novotna profesionālajā tenisā 14 sezonās izcīnīja 24 WTA vienspēļu titulus un 76 dubultspēļu trofejas.
1998.gadā viņa triumfēja Vimbldonas čempionātā, tikdama pie sava karjerā vienīgā Grand Slam vienspēļu titula. Daudz labāk viņai klājās dubultspēlēs, kur tika izcīnīti 12 Grand Slam tituli, bet jauktajās dubultspēlēs viņa tika pie četriem tituliem.
Novotna 1988.gadā palīdzēja Čehoslovākijas tenisistēm triumfēt Federāciju kausā un tajā pašā gadā izcīnīja Seulas olimpisko spēļu sudraba medaļu dubultspēļu sacensībās. 1996.gada Atlantas olimpiskajās spēlēs Novotna, jau zem Čehijas karoga, vienspēlēs izcīnīja bronzu, bet dubultspēlēs guva vēl vienu sudraba godalgu.
2005.gadā Novotna tika uzņemta tenisa Slavas zālē. Pēc profesionāles karjeras beigām viņa kļuva par treneri.