EK uz laiku apturējusi ES fondu maksājumus Reģionālās attīstības fonda (ERAF) programmās Uzņēmējdarbība un inovācijas un Infrastruktūra un pakalpojumi. Kā informēja EK pārstāvniecības Latvijā pārstāve Sanita Jemberga, EK lēmuma pamatā ir trīs revīzijas ziņojumi no Latvijas atbildīgās fondu audita iestādes, kuros konstatēti būtiski trūkumi ES fondu vadībā un uzraudzībā. EK tos uzskatīja par pietiekami nopietniem, lai pagaidām apturētu maksājumus.
EK informējusi Latviju, ka Finanšu ministrijai (FM) kā fondu vadošajai iestādei trūkst ietekmes mehānisma attiecībā uz atbildīgo nozaru ministriju un aģentūru pieņemtajiem lēmumiem par fondu līdzekļu izlietojumu. Latvijai uzdots divu trīs mēnešu laikā izstrādāt rīcības plānu un novērst trūkumus vadības un kontroles sistēmā. S. Jemberga skaidro, ka EK lēmums nav nekas ārkārtējs. Izmaksa pārtraukta uz laiku, kamēr trūkumi tiks novērsti. Arī fondu nauda netiek zaudēta. Lai maksājumus atjaunotu, parasti pietiek ar pārliecinošu ziņojumu no attiecīgās dalībvalsts, kurā apliecināts, ka problēmas ir novērstas.
ES fondu vadošā iestāde EK lēmumu uzskata par pārmērīgu. FM turpinās sadarbību ar EK, skaidrojot sistēmas pamatprincipus un pārliecinot par pilnvērtīgu sistēmas darbību. Attiecībā uz ES fondu līdzekļu cirkulāciju FM paskaidro, ka ieguldīto naudu projektu īstenotājiem vispirms atmaksā no valsts budžeta līdzekļiem. Pēc tam Latvija EK iesniedz izdevumu deklarācijas par projektos veiktajām atmaksām un saņem no EK atmaksas savā budžetā. Tāpēc arī patlaban projektu īstenotāji turpina saņemt maksājumus.