Financial Times raksta, ka V. Jakuņina aiziešana no Krievijas dzelzceļa būtu jāvērtē kā lielākā kadru pārmaiņa V. Putina komandā kopš 2012. gada, kad Krievijas prezidenta administrācijas vadītāja pirmā vietnieka amatu pameta Vladislavs Surkovs. «Kāds Kremlim tuvs avots pavēstīja, ka šis solis, iespējams, ir daudz plašāku pārmaiņu elements. Tiesa, citi Krievijas notikumu vērotāji aizrāda, ka baumas par Jakuņinu tiek aktīvi izplatītas laiku pa laikam, taču līdz šim viņš saglabājis savu amatu. Pirms diviem gadiem valstij piederošie mediji paziņoja par viņa atkāpšanos no amata, taču pēc pusstundas šīs ziņas tika atsauktas,» vēsta Financial Times.
Savukārt Vedomosti citē kādu prezidenta administrācijai tuvu cilvēku, kurš apgalvo, ka rīkojums V. Jakuņinam atkāpties no amata, visticamāk, saņemts no Kremļa un tas varētu būt sods. «Veids, kā tas notika, liecina, ka viens no galvenajiem motīviem bijusi vēlme Jakuņinu par kaut ko sodīt.»
Politologs Gļebs Pavlovskis paziņojis, ka šādas izmaiņas V. Putinam tuvākajās aprindās nenotiek bez valsts vadītāja ziņas, savukārt viņš par tādām izšķiroties tikai ārkārtējos gadījumos: «Tagad sāksies dažādu koalīciju pārveidošana, taču cilvēku tajās ir tik maz, ka ikviena pārbīde nozīmīgi satricina valsts aparāta līdzsvara sistēmu. Kremļa iekšienē vienmēr notiek sava veida pozicionālais karš, taču šādas asas pārmaiņas pilnībā izmaina frontes līnijas, pastiprinot vienu, vājinot citu, taču tas īsti nav Putina stilā, jo viņam nepatīk mainīt tuvākā loka cilvēkus.»
Politologs Vladimirs Pribilovskis paudis viedokli, ka V. Jakuņina aiziešana uz Krievijas Federācijas padomi (parlamenta augšpalāta) būs pazeminājums amata rangā, ja vien viņš nekļūs par Federācijas padomes spīkeru. Pazīstamais Krievijas opozicionārs Aleksejs Navaļnijs intervijā Eho Moskvi paudis viedokli, ka V. Jakuņins dzelzceļa vadītāja amatā kļuva par korupcijas simbolu: «Jakuņins neapšaubāmi ir viens no viskorumpētākajiem ierēdņiem Krievijas Federācijā un ir pat kļuvis par korupcijas simbolu. Turklāt viņš sevi pozicionē kā lielu Krievijas lielvalstiskuma ideologu. Un, lai gan pašam visa nauda izvietota ārzemēs, viņš raksta pamācošus rakstus par to, kā mums visiem jācīnās pret Ameriku.»